Placé sous la direction de l’Administrateur Délégué Général, l’Office Congolais de Contrôle est administré par un Conseil d’Administration avec l’appui d’une instance exécutive, le Comité de Gestion.

Les entités opérationnelles de l’Office sont structurées en Départements spécialisés. Son réseau d’implantations, couvrant l’ensemble du territoire de la République Démocratique du Congo, est constitué par les Directions Provinciales et leurs Agences rattachées.